Авторская живопись XVII века, с изображением в среднике Иоанна Предтечи в молении и сцены усекновения его главы, а в клеймах – жития святого, довольно скоро перестала быть различимой, так как покрывавшая ее олифа потемнела.

Икона была частично записана в последующих столетиях, а на рубеже XIX–XX веков на всю ее поверхность была нанесена масляными красками новая композиция, которая непрофессионально повторяла известную роспись М.В. Нестерова «Рождество Христово» в киевском Владимирском соборе. Пробное раскрытие показало наличие нескольких слоев записи и удовлетворительную сохранность авторской живописи. Полное раскрытие осуществлялось несколько лет, причем этим процессом (под руководством реставраторов М.А. Скутте и Ю.В. Лариной) занимались студенты-практиканты факультета живописи.

В ходе реставрационных работ были проведены укрепление красочного слоя и левкаса, а также рыхлой древесины. Была отреставрирована конструкция основы, удалены потемневшая олифа и многослойные записи, восполнены мелкие утраты. Поверхность была покрыта защитным слоем, оборот завощен. Реставраторам приходилось решать и новые задачи, связанные с укреплением обожженной древесины и подвергшегося плесневому заражению красочного слоя,  с просушкой и укреплением при помощи левкаса.  Кроме того, потребовалось раскрыть авторский красочный слой, «спекшийся» в результате температурного воздействия со слоем потемневшей олифы.