К 2010 году реставрация картины была почти завершена, оставалось только покрыть произведение лаком и восстановить утраты красочного слоя методом тонирования. Завершению реставрационных работ помешал пожар, вспыхнувший в здании ВХНРЦ в июне 2010 года. Во время происшествия картина стояла на мольберте непосредственно под очагом пожара и испытала на себе воздействие экстремальных температур, а также влаги и химии в процессе тушения пожара.

В результате вследствие намокания и перепадов температур возникла сильная деформация основы и её провисание, а после полного высыхания холста – его усадка. Также появились прорывы основы, многочисленные ожоги, вздутия красочного слоя и лака. Местами возникли угрозы осыпей, утраты красочного слоя и грунта, разложение лаковой плёнки и сильное загрязнение, в котором сочетались пыль, копоть, остатки химических средств, использовавшихся при тушении пожара, а также остатки пластика, оплавившегося с перекрытия здания, и мелкие включения сгоревшей древесины. В верхней части картины, находившейся ближе к эпицентру пожара, лаковая пленка фактически спаялась с красочным слоем. Реставрацию картины предстояло провести заново.

Наиболее сложный этап реставрации был связан с разработкой методов укрепления обгоревшего красочного слоя и укладки вздутий и кракелюра. В «Портрете Александра I» Дж. Доу использовал множество лаковых лессировок, и существовала большая опасность снятия лаковой плёнки вместе с красочным слоем. Другая трудность заключалась в том, что характер вздутий красочного слоя картины был неоднородным (одни были более жесткими, другие полыми). Всё это требовало индивидуального подхода при размягчении вздутий на каждом отдельном участке и большой осторожности при выборе времени экспозиции компрессов. После разработки методики, началась работа по укреплению красочного слоя. Затем, после удаления поверхностных загрязнений, была устранена деформация холста, подведен реставрационный грунт. Непростой этап реставрации был связан с работой с лаковой плёнкой – велись поиски метода по утоньшению и выравниванию покровного слоя, пострадавшего в пожаре. По мере размягчения, утоньшения и выравнивания лака реставратору одновременно приходилось удалять следы вскипевшей пластмассы, вплавившейся в лак, а местами даже в красочный слой во время пожара. Далее лак был отрегенерирован в местах разложения, и, наконец, в завершение реставрационных работ, картина была покрыта лаком, а места утрат авторского красочного слоя – затонированы.

Реставрационные работы были начаты летом 2012 года стажёрами Е.О. Богомоловой и Е.В. Саломатиной под руководством художника- реставратора С.А. Леваева. На данном этапе была проведена пробная регенерация лака, сделаны пробы на укрепление красочного слоя. Кроме того, по всей поверхности картины была устранена щелочная среда, возникшая в результате тушения пожара. Стажёры заделали прорывы и растянули картину на рабочем подрамнике, с целью устранения деформации